BAKTERİYEL 16S RRNA GEN DİZİLEMESİ

Bakteriyel 16S rRNA gen dizilemesi, bakterilerin tanımlanmasında kullanılan hedefli bir moleküler yöntemdir. Genin korunmuş ve değişken bölgelerinden elde edilen bilgi, bilinen dizilerle karşılaştırılır. Kültürde zor üreyen bakterilerde veya antibiyotiklerden sonra canlılığı azalan etkenlerde tanımlamaya yardımcı olabilir. Bu yöntem insanın kalıtsal özelliklerini araştırmaz; bakteriyel hedefe yönelik laboratuvar incelemesidir. Kullanılan veri tabanı, bildirilen tanımlamanın dayanağının bir parçasıdır.

İncelemenin amacı, klinik olarak anlamlı bir örnekte bakteriyel DNA araştırmaktır. Pozitiflik enfeksiyonu destekleyebilir; ancak çevresel veya bulaşmış DNA da saptanabilir. Negatiflik enfeksiyonu kesin olarak dışlamaz. Düşük miktarda etken, örnekleme sorunu veya incelemeyi engelleyen maddeler sonucu etkileyebilir. Yöntem virüs, mantar ve parazitleri araştıran bütün testlerin yerine geçmez. Başarılı tedaviden sonra DNA kalabildiğinden iyileşmeyi doğrulayan bir test sayılmaz.

Örnek türünün uygunluğu incelemeyi yapacak laboratuvarla netleştirilmelidir. GOSH hizmeti normalde steril bölgelerden gelen uygun sıvı ve dokuları kabul ederken, steril olmayan bazı örnekleri geniş kapsamlı bakteriyel PCR için kabul etmez. Bu koşullar belirli bir hizmetin sınırlarıdır.

İsteklerin uzman mikrobiyolog veya klinik bilim insanıyla görüşülmesi, testin hangi soruya yanıt vereceğini açıklığa kavuşturur. Pozitif sonuç ayrıca klinik anlam bakımından görüşülür.

Klinik katkı, yalnız pozitif sonuç oranıyla ölçülmez. İki yıllık geriye dönük bir araştırmada değerlendirmeye alınan 282 olgunun 145’inde tanısal, 77’sinde tedavi kararına yönelik katkı bildirildi. İkinci kategori, mevcut tedavinin sürdürülmesini de içeriyordu; her katkı ilaç değişikliği anlamına gelmiyordu. Seçilmiş bir merkez deneyimi olan bu sonuç, bütün hastalarda aynı yararın elde edileceğini göstermez.

Çocuklarda yapılan ayrı bir çalışmada 124 hastaya ait 162 incelemenin 33’ü pozitifti. Pozitif örneklerin önemli bir bölümü kültür negatifti. Bu bulgu, seçilmiş olgularda tamamlayıcı tanısal katkıyı gösterir; genel duyarlılık veya tedavi başarısı ölçümü değildir. Test sayısı ile hasta sayısının farklı olduğu unutulmamalıdır. Sonuçlar bütün çocuklara aynı pozitiflik beklentisiyle uygulanamaz.