DNA TEKRAR GENİŞLEMESİ ANALİZİ

DNA tekrar genişlemesi analizi, belirli bir DNA dizisinin bir bölgede kaç kez yinelendiğini ve bu tekrarın hastalıkla ilişkili aralığa ulaşıp ulaşmadığını araştırır. Küçük dizi değişikliklerini saptayan bir testin çok uzun tekrarları aynı doğrulukla ölçtüğü varsayılamaz. Kısa okuma dizilemesi, tekrar uzunluğu ve yapısı nedeniyle özel analiz ve gerektiğinde ek doğrulama gerektirir.

Test seçimi klinik soruya dayanır. Örneğin açıklanamayan ataksi değerlendirmesinde nörolojik muayene, aile öyküsü ve genetik olmayan nedenler birlikte ele alınır. Genom dizilemesi isteniyorsa hastalıkla ilişkili tekrarları güvenilir biçimde saptayacak yöntemin gerçekten dahil olduğu doğrulanmalıdır. Böyle bir hizmet mümkün değilse, uygun tekrar genişlemesi paneli başka bir başlangıç seçeneği olabilir.

Bir genişlemenin varlığını göstermek ile kesin tekrar sayısını belirlemek farklı görevlerdir. C9orf72 için bazı yöntemler genişlemeyi saptasa da büyük allelin boyutunu yalnız tahmin eder. Kan DNA’sı bu genişlemenin varlığını araştırmakta kullanılabilir; bu örnek tüm tekrar hastalıklarında bütün doku farklılıklarının önemsiz olduğu anlamına gelmez. Kullanılan yöntem ve rapor sınırı önemlidir.

Birleşik Krallık araştırmasında genom dizilemesi, 404 hastanın önceki PCR sonuçlarıyla karşılaştırıldığında 13 bölgede yüksek duyarlılık ve özgüllük göstermiştir. Bununla birlikte sonraki klinik değerlendirmede genişleme diye işaretlenen 81 bulgunun tamamı hastalık aralığında doğrulanmamıştır. Bu ayrım, bilgisayarın işaretlediği bir sonucu doğrudan kesin tanı kabul etmemenin nedenini gösterir.

Rapor; normal, ara veya hastalıkla ilişkili aralıkların hangi gene göre tanımlandığını, yöntemin sınırlarını ve gerekli doğrulamayı açıklamalıdır. Sayısal tahminin belirsizlik aralığı başka bir kategoriye taşıyorsa ek inceleme gerekebilir. Özellikle belirtisiz kişilere yalnız tekrar sayısına bakarak kesin başlangıç yaşı veya belirtiler hakkında kişisel tahmin verilmemelidir.

Ataksi bağlamındaki öneriler, sonuç pozitif ya da negatif olsa da test sonrası danışmanlığı destekler. Aile bireyleri için olası sonuçlar konuşulur. Negatif test, değerlendirmeyi bitiren tek bir cümle değil, sonraki klinik sorunun belirlenmesinde kullanılan bir bilgidir.