FLORESAN İN SİTU HİBRİDİZASYON TESTİ

Floresan in situ hibridizasyon, kısaca FISH, kromozom üzerindeki belirli DNA dizisini görünür kılan bir laboratuvar yöntemidir. Hedef diziye bağlanmak üzere tasarlanmış küçük DNA parçası, floresan işaret taşıyan prob olarak kullanılır. Mikroskopla görülen işaretin konumu araştırılan bölgeyi gösterir. Bu, DNA dizisinin bütün harflerinin tek tek okunmasıyla aynı işlem değildir.

FISH hedefli bir incelemedir: hangi bölgenin araştırılacağı önceden belirlenir. NHS genomik eğitim kaynağı, yöntemin kopya sayısı ve kromozomdaki yerleşim hakkında bilgi sağlayabildiğini belirtir. Metafaz incelemesi konumsal bilgi verebilirken hücre kültürü gerektirir. İnterfaz incelemesinin verdiği bilgi farklıdır; iki yaklaşım, aynı soruya her koşulda eşdeğer yanıt sağlamaz.

Oxford’un nadir hastalık hizmetinde FISH, kromozom değişikliğini ayrıntılandırmak, ailede izlemek veya olası mozaikliği araştırmak için kullanılabilir. Kültürlü ya da kültürsüz hücre hazırlıkları değerlendirilebilir. Kullanılacak probun belirli bir DNA bölgesine özgü olması önemlidir; laboratuvara bildirilen klinik soru, rastgele geniş bir araştırma yerine uygun hedefin seçilmesini sağlar.

Tek bir normal FISH sonucu, araştırılmamış bütün kromozom bölgelerinin normal olduğu anlamına gelmez. Atipik yeniden düzenlenmeler gözden kaçabilir; sinyallerin üst üste binmesi veya başka dizilere bağlanması yorum güçlüğü yaratabilir. Sonucu deneyimli personel değerlendirmelidir. Yöntem, uniparental dizomiyi gösteren genel bir test olarak kullanılmaz ve bütün mikrodelesyonlar için tek seçenek değildir.

Bir özgün araştırmada klinik olarak 22q11.2 değişikliği düşünülen, FISH sonucu normal veya bilgi vermeyen 101 kişi mikrodiziyle incelenmiştir. Ek bulgular saptanması, hedefli incelemenin sınırını gösterir. Ancak grubun bir bölümünde FISH hiç yapılamamış veya teknik olarak başarısız olmuştur; bu kişiler normal sonuç almış sayılarak yöntemin yanlış negatiflik oranı hesaplanamaz.

Aile için önemli olan, testin hangi soruyu yanıtladığının anlaşılmasıdır. Oxford hizmeti, FISH’in mevcut kromozom bulgusunu açıklığa kavuşturmak ve yakınlarda aynı değişikliği araştırmak için kullanılabildiğini belirtir. Bu hedefli yaklaşımın sonucunu başka bir yöntemle yapılmış tüm genom değerlendirmesi gibi okumamak gerekir; inceleme kapsamı raporla birlikte ele alınır.