KROMOZOMAL MİKRODİZİ ANALİZİ

Kromozomal mikrodizi analizi, DNA parçalarının eksik veya fazla kopyalarını genom boyunca araştırır. Klasik karyotipte görünmeyebilen küçük değişiklikleri gösterebilir; ancak aynı bilgiyi daha ayrıntılı biçimde veren kusursuz bir karyotip değildir. Dengeli yeniden düzenlenmeler, tek harflik DNA değişiklikleri ve düşük düzeyli mozaiklik gibi durumlar yöntemin sınırları içinde değerlendirilir.

Bir kopya sayısı değişikliğinin bulunması, bütün belirtilerin nedeninin kesinleştiği anlamına gelmez. ACMG ve ClinGen çerçevesi, varyantın kanıta dayalı sınıflandırmasını kişinin özel klinik durumundaki etkisinden ayırır. Aynı değişikliğin gen içeriği, doz duyarlılığı, ailede görülme biçimi ve mevcut bilgiler değerlendirilir; yalnız laboratuvarın renkli işaretine dayanılmaz.

Aileye normal, açıklayıcı veya belirsiz sonuç olasılıkları önceden anlatılmalıdır. Normal sonuç bütün genetik hastalıkları dışlamaz; tek bir gendeki değişiklik mikrodizide görünmeyebilir. Belirsiz bulguda anne ve babadan örnek istenmesi yoruma yardım edebilir. Bununla birlikte aile incelemesi yapılması her belirsizliğin mutlaka çözüleceği anlamına gelmez.

Testin sırası hastanın başvuru nedenine ve yerel genetik değerlendirme yoluna bağlıdır. Kanada Pediatri Derneği, açıklanamayan genel gelişim gecikmesi veya zihinsel gelişim bozukluğu olan çocuk ve gençlerde mikrodiziyi ilk basamak inceleme olarak önerir. Aynı öneri, ayrıntılı öykü, muayene, işitme ve görme değerlendirmesinin yerine geçmez; bütün erişkinlere yönelik tarama kuralı değildir.

Prenatal tanıdaki büyük bir özgün araştırma, normal karyotipe rağmen mikrodizinin ek klinik anlamlı bulgular sağlayabildiğini göstermiştir. Bunun büyüklüğü başvuru nedenine göre değişmiştir. Çalışma eski platformlarla yapılmıştır; yöntem performansını bugünkü bütün laboratuvarlara birebir taşımak doğru değildir. Saptama yararı ile belirsiz bulguların danışmanlık yükü birlikte düşünülmelidir.

Mikrodizi raporunda kullanılan platform ve hangi değişikliklerin saptanabildiği açık olmalıdır. SNP içeren ve içermeyen sistemler aynı ek bilgileri sağlamaz. Örneğin homozigotluk örüntüsü veya bazı ploidilik değişiklikleri için platformun özellikleri önemlidir. Rapor klinik soruya yanıt vermeli; gerekiyorsa ek incelemenin amacı ve uygun örnek türü belirtilmelidir.